Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
YTHDC1Q96MU7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms