Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NEURL4Q96JN8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NEURL4Q96JN8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEURL4Q96JN8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEURL4Q96JN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms