Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GCC1Q96CN9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms