Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLP1Q92989 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLP1Q92989 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms