Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PHF3Q92576 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PHF3Q92576 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms