Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELQQ8TDG4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HELQQ8TDG4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms