Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBI5

SLC43A3, Solute carrier family 43 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC43A3Q8NBI5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC43A3Q8NBI5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC43A3Q8NBI5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms