Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
YTHDF3Q7Z739 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
YTHDF3Q7Z739 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms