Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CATSPER4Q7RTX7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms