Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
XIRP1Q702N8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
XIRP1Q702N8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms