Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf47Q6ZRZ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf47Q6ZRZ4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms