Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C16orf54Q6UWD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C16orf54Q6UWD8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms