Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSBN1Q5VWQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSBN1Q5VWQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms