Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF38BQ5VTL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF38BQ5VTL8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms