Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC01545Q5VT33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC01545Q5VT33 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms