Protein–RNA interactions for Protein: Q5EE01

CENPW, Centromere protein W, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPWQ5EE01 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPWQ5EE01 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPWQ5EE01 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms