Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRY2Q49AN0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CRY2Q49AN0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms