Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSPP1Q1MSJ5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms