Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TIGD6Q17RP2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms