Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SGCAQ16586 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms