Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYTH1Q15438 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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