Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LAPTM4AQ15012 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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