Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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GPNMBQ14956 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GPNMBQ14956 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
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