Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSHL1Q14406 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms