Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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