Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IRF5Q13568 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRF5Q13568 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms