Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
XRCC4Q13426 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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