Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RIGQ13278 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RIGQ13278 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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