Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)24.1■■□□□ 1.453e-8■■■■□ 24.3
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TARDBPQ13148 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.23e-8■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.063e-8■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 213.46□□□□□ -0.253e-8■■■■□ 24.3
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TARDBPQ13148 PAK4-212ENST00000602004 564 ntTSL 418.99■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 24.3
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TARDBPQ13148 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.431e-11■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 MYO9B-218ENST00000602158 495 ntTSL 311.84□□□□□ -0.511e-11■■■■□ 24.3
TARDBPQ13148 MYO9B-203ENST00000593533 978 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.741e-11■■■■□ 24.3
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TARDBPQ13148 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.617e-7■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 11e-7■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-7■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-7■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 INPP5A-201ENST00000342652 832 ntTSL 59.89□□□□□ -0.838e-7■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 37.13□□□□□ -1.277e-7■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 MAEA-216ENST00000512308 839 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 216.57■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-10■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 319.84■□□□□ 0.777e-7■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 24.2
TARDBPQ13148 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.577e-7■■■■□ 24.2
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TARDBPQ13148 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.53e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.989e-7■■■■□ 24
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TARDBPQ13148 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.269e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SFT2D1-204ENST00000487841 2576 ntTSL 1 (best)12.1□□□□□ -0.479e-7■■■■□ 24
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TARDBPQ13148 BACH1-209ENST00000546469 485 ntTSL 33.39□□□□□ -1.879e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 BACH1-211ENST00000548219 325 ntTSL 23.39□□□□□ -1.879e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 BACH1-212ENST00000548467 217 ntTSL 23.39□□□□□ -1.879e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SLC45A4-205ENST00000520137 835 ntTSL 318.81■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SLC45A4-206ENST00000521804 726 ntTSL 318.74■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.642e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 24
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TARDBPQ13148 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-214ENST00000604123 757 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 24
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TARDBPQ13148 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 411.21□□□□□ -0.612e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 TMEM91-204ENST00000413014 650 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 CCAR1-218ENST00000630771 4540 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.236e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.446e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 SND1-216ENST00000492840 472 ntTSL 56.09□□□□□ -1.436e-7■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-210ENST00000591268 576 ntTSL 418.93■□□□□ 0.624e-6■■■■□ 24
TARDBPQ13148 HDHD2-212ENST00000591671 557 ntTSL 218.87■□□□□ 0.614e-6■■■■□ 24
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