Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms