Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRDNQ13061 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRDNQ13061 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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