Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTN1Q12860 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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