Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SCAPQ12770 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms