Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 PRK1YIL095W 2433 nt1.92□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 SSY1YDR160W 2559 nt1.92□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 REV1YOR346W 2958 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 DPB11YJL090C 2295 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 HNT1YDL125C 477 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 YHC1YLR298C 696 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 GIP3YPL137C 3831 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 BRO1YPL084W 2535 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 NAB6YML117W 3405 nt1.91□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 NCL1YBL024W 2055 nt1.9□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 SET2YJL168C 2202 nt1.9□□□□□ -2.1
RPN6Q12377 AHC2YCR082W 387 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDL032WYDL032W 312 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 snR84snR84 550 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 EMC4YGL231C 573 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 TPM2YIL138C 486 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 PEP8YJL053W 1140 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YLR379WYLR379W 375 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YLR458WYLR458W 381 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RPS17AYML024W 411 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SIP18YMR175W 240 nt1.9□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 CRD1YDL142C 852 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 CAJ1YER048C 1176 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SPC1YJR010C-A 285 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 VTI1YMR197C 654 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YOR105WYOR105W 327 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RSA1YPL193W 1146 nt1.89□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 CDC50YCR094W 1176 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 BER1YLR412W 825 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 URA10YMR271C 684 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YPR153WYPR153W 423 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.88□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SPR3YGR059W 1539 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 INO80YGL150C 4470 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RTR2YDR066C 591 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDR220CYDR220C 294 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 EMP24YGL200C 612 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 TIM10YHR005C-A 282 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YKR051WYKR051W 1257 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YLR271WYLR271W 825 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 IST2YBR086C 2841 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.87□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 AGC1YPR021C 2709 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDL016CYDL016C 303 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 PRM8YGL053W 714 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RNR4YGR180C 1038 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RPL40AYIL148W 387 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 BUD19YJL188C 309 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 ILM1YJR118C 612 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RLP24YLR009W 600 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 LCL2YLR104W 396 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 CCW14YLR390W-A 717 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YNL010WYNL010W 726 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 UTP13YLR222C 2454 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 NEO1YIL048W 3456 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 MDM32YOR147W 1869 nt1.86□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 GYP5YPL249C 2685 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 NIC96YFR002W 2520 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 MET32YDR253C 576 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 MZM1YDR493W 372 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SNC1YAL030W 354 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 CMS1YLR003C 876 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 LSM7YNL147W 348 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 ATX2YOR079C 942 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 MEI5YPL121C 669 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YBR071WYBR071W 636 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YPR172WYPR172W 603 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YMR045CYMR045C 5268 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 DIS3YOL021C 3006 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.85□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 KAP123YER110C 3342 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 VPH1YOR270C 2523 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SOK2YMR016C 2358 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 SEC31YDL195W 3822 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YPS5YGL259W 498 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 YLR031WYLR031W 561 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 UBX4YMR067C 1251 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RPS7BYNL096C 573 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 RPB11YOL005C 363 nt1.84□□□□□ -2.11
RPN6Q12377 BNA7YDR428C 786 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 TIM8YJR135W-A 264 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 YJR141WYJR141W 1044 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 PHO80YOL001W 882 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 YPL197CYPL197C 414 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 TRL1YJL087C 2484 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 SIR4YDR227W 4077 nt1.83□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 NAN1YPL126W 2691 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 APQ13YJL075C 417 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 CSI1YMR025W 888 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 ICY1YMR195W 384 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 RCN2YOR220W 798 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 SVS1YPL163C 783 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 ATP15YPL271W 189 nt1.82□□□□□ -2.12
RPN6Q12377 BFA1YJR053W 1725 nt1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 86.3 ms