Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP1Q04837 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms