Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
ATP7AQ04656 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATP7AQ04656 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms