Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FANCCQ00597 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms