Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNA1P78396 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNA1P78396 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms