Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB4BP68371 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB4BP68371 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms