Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB11AP62491 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms