Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
RPS29P62273 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RPS29P62273 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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