Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HERVK_113P61574 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms