Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DEFA1P59665 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms