Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLCNKBP51801 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms