Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSNK1EP49674 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms