Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC6A9P48067 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC6A9P48067 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms