Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YJL007CYJL007C 315 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 PRE8YML092C 753 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 CTK3YML112W 891 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 DDR48YMR173W 1293 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YOR055WYOR055W 435 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YPL276WYPL276W 438 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 IRC16YPR038W 360 nt2.24□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 FMP16YDR070C 282 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 GPI8YDR331W 1236 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 BNA7YDR428C 786 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RPL27BYDR471W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 TOM22YNL131W 459 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YPL205CYPL205C 345 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RGA1YOR127W 3024 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 BNI1YNL271C 5862 nt2.23□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YNL034WYNL034W 1839 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 ECM5YMR176W 4236 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RTR2YDR066C 591 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 RNR4YGR180C 1038 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 YHR130CYHR130C 336 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 EMC6YLL014W 327 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 VMA9YCL005W-A 222 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 SSD1YDR293C 3753 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 SAC3YDR159W 3906 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 IRC8YJL051W 2469 nt2.22□□□□□ -2.05
MDE1P47095 MET18YIL128W 3099 nt2.21□□□□□ -2.05
MDE1P47095 PRK1YIL095W 2433 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 NIC96YFR002W 2520 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 TSA2YDR453C 591 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 BI2Q0110 1272 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YFL019CYFL019C 354 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 SPC1YJR010C-A 285 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YLR171WYLR171W 390 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YPL080CYPL080C 327 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RPB5YBR154C 648 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 MGM1YOR211C 2646 nt2.21□□□□□ -2.06
MDE1P47095 PKR1YMR123W 369 nt2.2□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YPL039WYPL039W 951 nt2.2□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RTT107YHR154W 3213 nt2.2□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RAV1YJR033C 4074 nt2.2□□□□□ -2.06
MDE1P47095 ELG1YOR144C 2376 nt2.2□□□□□ -2.06
MDE1P47095 SPE1YKL184W 1401 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 DPB11YJL090C 2295 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YCR064CYCR064C 411 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RPI1YIL119C 1224 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 PEP8YJL053W 1140 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YKL202WYKL202W 582 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 snR41snR41 95 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 SMC6YLR383W 3345 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 UTP13YLR222C 2454 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 MCD1YDL003W 1701 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 PTC5YOR090C 1719 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 SSE1YPL106C 2082 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 UBP11YKR098C 2154 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 MUD2YKL074C 1584 nt2.19□□□□□ -2.06
MDE1P47095 IRC4YDR540C 540 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YPS5YGL259W 498 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 AIM29YKR074W 468 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RRT1YBL048W 312 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 GRR1YJR090C 3456 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
MDE1P47095 TRL1YJL087C 2484 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YGL165CYGL165C 579 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 LAG1YHL003C 1236 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 BIG1YHR101C 1008 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YJR023CYJR023C 402 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 AIM32YML050W 936 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 NOP15YNL110C 663 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 RUD3YOR216C 1455 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 NDD1YOR372C 1665 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 STE11YLR362W 2154 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 KAP123YER110C 3342 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YOL098CYOL098C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt2.17□□□□□ -2.06
MDE1P47095 HER1YOR227W 3741 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 UBR1YGR184C 5853 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YGR042WYGR042W 816 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 TPM2YIL138C 486 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YJR079WYJR079W 330 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 CMS1YLR003C 876 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 MPH1YIR002C 2982 nt2.16□□□□□ -2.06
MDE1P47095 TMN3YER113C 2121 nt2.15□□□□□ -2.06
MDE1P47095 GDS1YOR355W 1569 nt2.15□□□□□ -2.06
MDE1P47095 SMB1YER029C 591 nt2.15□□□□□ -2.07
MDE1P47095 SHE2YKL130C 741 nt2.15□□□□□ -2.07
MDE1P47095 YML108WYML108W 318 nt2.15□□□□□ -2.07
MDE1P47095 RPS7BYNL096C 573 nt2.15□□□□□ -2.07
MDE1P47095 YPL197CYPL197C 414 nt2.15□□□□□ -2.07
MDE1P47095 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.15□□□□□ -2.07
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