Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RPL4P36578 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RPL4P36578 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms