Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TRIM23P36406 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM23P36406 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms