Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACTN2P35609 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN2P35609 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms